首页 期刊 江苏农业科学 不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析 【正文】

不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析

作者:杨佳栋; 刘月琴; 张英杰 河北农业大学动物科技学院; 河北保定071000
哺乳动物   gdf9   碱基替换   密码子偏性   聚类分析  

摘要:为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过Codon W软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲缘关系。GCT、TGT、TTT、ATT、CCT、AGA、ACT为哺乳动物GDF9基因的最优密码子,该基因偏爱使用以A或T结尾的密码子;G、C含量和蛋白质亲水性是影响GDF9基因密码子偏性的主要因素;聚类分析提示不同哺乳动物间的同源性越高,GDF9基因密码子使用特征的相似性越高。

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