首页 期刊 江苏农业科学 蓖麻RcSCP基因克隆与生物信息学分析 【正文】

蓖麻RcSCP基因克隆与生物信息学分析

作者:冯紫洲; 刘春梅; 衡宝山; 张继星; 陈永胜; 王云; 刘海臣; 穆莎茉莉; 冀照军; 霍红雁 内蒙古民族大学农学院; 内蒙古通辽028000; 内蒙古阿鲁科尔沁旗农业局; 内蒙古赤峰025550; 内蒙古民族大学生命科学学院; 内蒙古通辽028000; 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心/内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室/内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心; 内蒙古通辽028000
蓖麻   race   丝氨酸羧肽酶   克隆  

摘要:植物的丝氨酸羧肽酶(serine carboxypeptidases,简称SCP)是一类属于邶水解酶家族的蛋白酶,在许多生化途径(包括次生代谢产物的生物合成、催化酰基转移、除草剂共轭、种子萌发相关蛋白质的降解过程)中起着重要作用。丝氨酸羧肽酶基因是植物的一种抗逆基因,在植物生长发育及抵抗逆境方面发挥着重要作用。蓖麻作为重要的油料作物,用途广泛。本研究利用cDNA末端快速克隆(RACE)方法克隆蓖麻RcSCP基因的3’端、5’端片段,最后设计全长引物获得蓖麻RcSCP全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,丝氨酸羧肽酶蛋白基因的eDNA完整开放阅读框序列为1377bp,推测它可编码458个氨基酸;蓖麻RcSCP蛋白含有丝氨酸羧肽酶蛋白家族保守区,预测它定位于细胞质中。

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