首页 期刊 暨南大学学报·自然科学与医学版 一种利用Spark-GPU加速CT图像重建的设计 【正文】

一种利用Spark-GPU加速CT图像重建的设计

作者:熊威; 曾有灵; 李喆 南方医科大学生物医学工程学院; 广东广州510515
spark   cuda   图像重建   并行计算   numba  

摘要:目的:进一步解决CT图像重建耗时长的问题,实现大批量重建CT图像.方法:利用大数据框架Spark构建GPU集群.首先对加速滤波反投影(FBP)和同时代数迭代重建技术(SART)算法的复杂度进行分析及并行化设计,并比较在GPU和CPU上的运行速度.通过对比耗时选择最佳的计算组合,实现单机GPU加速.通过thunder工具读取批量的投影数据并创建分布式数据集,使用Numba开发CUDA程序并部署在Spark运行.结果:FBP算法运行速度有近40倍的提升,SART算法运行速度有近10倍的提升.结论:Spark和GPU结合能够扩展Spark的性能,突破单机加速瓶颈,大幅提升计算速度,对于不同的图像重建算法均有良好的加速效果,表明Spark-GPU在图像重建方向有良好的应用前景.

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