首页 期刊 家畜生态学报 miR-92基因进化及在鸡不同发育时期组织表达谱和其功能预测分析 【正文】

miR-92基因进化及在鸡不同发育时期组织表达谱和其功能预测分析

作者:张蒙; 李芳; 蒋可人; 李国喜; 韩瑞丽; 李转见; 王彦彬; 康相涛; 孙桂荣 河南农业大学牧医工程学院; 河南郑州450002
进化   鸡   差异表达   靶基因   通路分析  

摘要:microRNA(miRNA)在不同物种间进化具有高度保守性,且在动物生长发育过程中有重要作用.为研究miR- 9 2的进化历史、miR- 9 2在不同组织的表达差异性和在生长发育过程中的作用,本文运用多序列比对分析序列相似性,并构建系统进化树分析miR- 9 2基因的进化特点,运用SYBR Green System PCR技术构建了 miR- 92在鸡不同发育阶段1 1 个组织中的表达谱,同时用TTargetScan 7. 0 与PicTTar两种不同生物学软件对其进行把基因预测,两个软件靶基因的交集分别进行GO和KEGG富集分析.结果表明(l )miR- 9 2 的进化方向与物种从低等到高等的进化趋势相一致,在不同物种中的基因位置和序列上都表现出较高的相似性,这与miRNA在物种间高度进化保守性的特点基本一致;(2 ) 同一个时期,不同组织部位的表达有组织特异性,在1 日龄的鸡中,腎脏,腿肌和心脏有较高的表达量.在成年鸡中,表达量较高的组织为肺脏,胸腺和下丘脑.在同一组织的1 日龄和成年鸡中的表达呈现时序性,除脾脏的表达量差异不显著外,其他1 0 个组织miR- 9 2的表达量差异显著(P 〈 0 . 05);(3)两个软件预测到的交集靶基因有1 5 7 个,GO富集结果显示靶基因主要参与转录过程,RN A代谢过程,DNA结合,转录因子活性,M APK磷酸酶活性等.显著富集的KEGG通路为MAPK信号通路(T 〈 0 . 0 5 ).这些结果为进一步研究miR- 9 2基因在机体中所扮演的角色奠定了基础.

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