首页 期刊 贵州医科大学学报 巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达 【正文】

巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达

作者:宋咏刚; 胡文慧; 余鹏; 石玉玲; 赵雪; 胡祖权; 王赟; 曾柱 贵州医科大学基础医学院; 贵州贵阳550025; 贵州医科大学贵州省免疫细胞与抗体工程研究中心生物与医学工程重点实验室; 贵州贵阳550025; 贵州医科大学生物与工程学院; 贵州贵阳550025
巨噬细胞   单核细胞   细胞骨架   生物信息学   基因芯片  

摘要:目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关。结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变。

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