摘要:目的:通过生物信息学方法,利用基因表达综合数据库(GEO)分析两种种植体表面(纳米/非纳米级)早期附着细胞的基因表达谱。方法:从GEO数据库下载芯片数据(GSE42288),运用R软件对42枚纳米级(纳米组)和42枚非纳米级表面处理(非纳米组)的迷你种植体周附着细胞的基因谱进行差异表达基因筛选,使用DAVID软件分别对差异基因进行GO及KEGG通路富集分析,同时使用STRING和Cytoscape软件进行蛋白质网络互作分析。结果:筛选出110个差异表达基因(上调7个,下调103个)。GO富集分析结果提示,差异基因在免疫反应、炎症反应、趋化因子调节、细胞凋亡通路等生物学过程及白细胞介素(IL)-8受体活化等分子功能中发挥重要作用;KEGG通路分析结果显示,差异表达基因主要在自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、破骨细胞分化、抗原加工提呈、趋化因子、细胞因子及其受体相互作用信号通路上发挥作用;GO、KEGG及蛋白互作网络分析筛选出纳米级种植体组主要的下调差异基因为VEGFA、CCL20、IL-8、CXCR1和CXCR2。结论:纳米级种植体更利于早期骨愈合,这可能与VEGFA、CCL20、IL-8、CXCR1和CXCR2基因的下调有关。
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