摘要:目的研究lncRNA H19遗传变异与肝癌易感性的关联,利用生物信息学的方法在实验前期筛选出H19中有潜在功能的SNPs。方法运用1000 Genomes Project和Ensembl等数据库确定H19 SNPs名录,利用Allele frequency calculator选取MAF值大于0.05的SNPs;结合文献查阅,运用SNP Function Prediction和F-SNP等功能预测软件筛选有潜在功能的SNPs。结果 5个SNPs在转录调控、蛋白质编码以及剪切调控中可能存在相应生物活性,值得进一步研究。结论对lncRNA H19的SNPs进行了科学合理的选择,可以更全面深入地探寻H19影响肝癌发生发展的遗传机制。
注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社