首页 期刊 干旱区研究 新疆野苹果果实总RNA提取方法的筛选 【正文】

新疆野苹果果实总RNA提取方法的筛选

作者:夏春兰; 闻志彬; 张玉芳 中国科学院新疆生态与地理研究所; 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室; 新疆乌鲁木齐830000; 中国科学院大学; 北京101408; 石河子大学生命科学学院; 新疆石河子832000
总rna   提取方法   改良ctab法  

摘要:由于新疆野苹果(Malus sieversii)果实富含多糖、多酚、可溶性果胶及其他次生代谢物质,导致果实的总RNA提取相对比较困难,质量较差。因此,本试验以不同发育时期的新疆野苹果的果实为材料,采用Ta KaRa试剂盒、全氏金试剂盒、田伟等改良的CTAB法、本试验改良的CTAB法(一)和CTAB法(二)这5种方法来摸索提取野苹果果实的总RNA的有效方法。结果表明:2种试剂盒均无法从野苹果果实中提取出RNA;通过3种改良CTAB法提取的RNA,在琼脂糖凝胶上得到清晰的28S和18S条带,并且纯度均较高,OD260/OD230值在1. 8~2. 2之间、OD260/OD230值大于2. 0。但是只有本试验改良CTAB法(一)获得较高的RNA产量,从5个不同发育时期的野苹果果实中提取的RNA平均值在116. 79~474. 76μg·g-1。改良CTAB法(一)通过延长Li Cl沉淀时间,将-20℃放置15 min改为4℃放置过夜(时间不超过16 h),可以有效地除去RNA中的杂质污染,使得RNA充分沉淀。这种改良方法耗时相对较长,需要2 d,但是方法易于操作且提取成本较低。因此,改良CTAB法(一)是适用于提取野苹果果实(尤其是发育晚期)总RNA的有效方法,完全可以满足后期的分子生物学试验所需。

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