首页 期刊 广东农业科学 黄瓜Ca2+家族序列特征及其表达特性分析 【正文】

黄瓜Ca2+家族序列特征及其表达特性分析

作者:盛慧; 杜伟玲 哈尔滨市农业科学院生物中心
黄瓜   组织特异性   信号传导  

摘要:通过黄瓜基因组数据库,采用生物信息学方法获得15个黄瓜Ca2+家族序列,并对其染色体位置、基因组位置、氨基酸长度、转录起始位点和Pfam匹配结构域数进行预测;利用RT-PCR方法对所有搜索到的Ca2+家族基因进行组织特异性分析;对黄瓜植株进行低温处理,分析黄瓜Ca2+基因家族的表达情况。结果显示:15个基因中除Csa021245未定位以外,其余均匀分布在16号染色体上,一致性为47.67%;Csa001688、Csa009857和Csa009360等3个基因的5′区出现CpG岛结构;组织表达特异性分析结果显示,Csa001688、Csa006826、Csa010172和Csa016434在叶中表达量最高,Csa003758、Csa010172和Csa018949在根中表达量最高;进化树分析结果显示,只有Csa010172和Csa009360与拟南芥AtACA2亲缘关系最近,这些基因可能在Ca2+家族信号传导过程中起着主要作用;实时定量表达分析表明,Ca2+基因家族参与黄瓜对低温胁迫的应答。

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