首页 期刊 分子植物育种 木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析 【正文】

木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析

作者:陈秀珍; 白雪杨; 朱云峰; 刘银弟; 江行玉; 周扬 海南大学热带作物学院海南省耐盐作物生物技术重点实验室; 海口570228; 海南大学园艺学院; 海口570228
esculenta   akt1   生物信息学分析  

摘要:植物细胞中的K^+通道蛋白AKT1(Arabidopsis K^+transpoter 1)主要负责吸收K^+。本研究基于木薯基因组数据库信息,利用PCR技术从木薯中克隆一个MeAKT1基因,该基因全长2634 bp,编码877个氨基酸,生物信息学分析表明MeAKT1含有10个外显子和9个内含子,编码的氨基酸分子量为99.02 kD,等电点为8.43,属于稳定蛋白。MeAKT1包含有5个跨膜区域,N端含有1个Ion_trans结构域,C端有1个KHA结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,进化树分析发现MeAKT1与蓖麻RcAKT1的亲缘关系最近。通过对MeAKT1蛋白的生物信息学分析有助于下一步深入研究MeAKT1在木薯耐贫瘠过程中的功能。

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