首页 期刊 分子植物育种 贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析 【正文】

贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

作者:兰青阔; 赵新; 陈锐; 王成; 陈笑芸; 汪小福; 王永; 兰璞 天津市农业质量标准与检测技术研究所; 天津300381; 浙江省农业科学院农产品质量标准研究所; 杭州310021
贝母属   叶绿体基因组   snp位点   生物信息学分析   检测方法  

摘要:贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法。本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析。结果发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22%,通过分析共发现SNP位点5879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1393个,伊贝母鉴别候选位点89个。本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑。

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