首页 期刊 分子植物育种 大豆GmTAA1-1基因的生物信息及时空表达分析 【正文】

大豆GmTAA1-1基因的生物信息及时空表达分析

作者:赵思华; 尹晗; 吕昊哲; 周文冠; 杨文钰; 舒凯 四川农业大学生态农业研究所; 农业部西南作物生理生态与耕作重点实验室; 成都611130
大豆   生物信息学分析   时空表达模式  

摘要:拟南芥TAA1基因是生长素合成途径上的一个重要组分,其在调控植物荫蔽胁迫响应过程中具有重要的功能。基于大豆基因组数据库,根据拟南芥TAA1蛋白的氨基酸序列,经比对分析,发现大豆中共有5个TAA1同源基因。本研究选取序列相似度最高的一个基因为对象,将其命名为GmTAA1-1 (GenBank登录号:XP003519828.1)。TMHMM软件和系统进化转录分析表明,GmTAA1-1基因编码的蛋白不具有信号肽,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;进化树分析表明,大豆GmTAA1-1和野生大豆亲缘关系较近。通过荧光定量PCR技术(qCPR),分析了GmTAA1-1在种子、根、茎、叶、花、豆荚等不同组织中的表达情况。结果表明,Gm TAA1-1在种子与豆荚中的表达量高于其他组织,具有一定的时空表达特异性,推测其可能与调控种子生命活动相关。本研究为进一步研究豆类作物的荫蔽反应提供了依据,有利于耐荫大豆的选择与培育,便于玉米大豆间套作种植模式的进一步推广。

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