首页 期刊 分子植物育种 上饶早梨全基因组重测序和转录组的关联分析 【正文】

上饶早梨全基因组重测序和转录组的关联分析

作者:尹明华; 吴平华; 刘邦旺; 胡光明; 王钦; 张红蕾 上饶师范学院生命科学学院; 上饶334001
上饶早梨   全基因组重测序   转录组   关联分析  

摘要:本研究对上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的全基因组重测序和转录组进行关联分析。结果表明:在进行差异InDel分析后,共有3 682个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在CV分析后,共有2 067个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在进行CNV分析后,与转录组差异基因数据进行了关联分析,其中分类为amplification的CNV中,属于显著差异的,并且倍性变化≥2倍的CNV,BR相对于HR有79个上调,42个下调;分类为deletion的CNV中,属于显著差异的,并且倍性变化≥2倍的CNV,BR相对于HR有149个上调,193个下调;分类为neutral的CNV中,属于显著差异的,并且倍性变化≥2倍的CNV,BR相对于HR有199个上调,196个下调。本试验结果可为上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的品种鉴定和品种选育提供理论依据。

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