首页 期刊 淡水渔业 不同基因型草鱼呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法的建立及应用 【正文】

不同基因型草鱼呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法的建立及应用

作者:范玉顶; 马杰; 周勇; 江南; 刘文枝; 曾令兵 中国水产科学研究院长江水产研究所; 武汉430223; 爱达荷大学水产研究所鱼类与野生动物科学系; 莫斯科83844-1136; 美国
不同基因型草鱼呼肠孤病毒   简并引物   vp2蛋白   快速检测  

摘要:根据GenBank登录的草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)不同基因型毒株编码VP2蛋白的S2节段保守序列,设计1对简并引物,通过优化反应条件及灵敏度和特异性评价,建立了一种能同时检测三种基因型GCRV的通用RT-PCR检测方法。结果显示:该方法在三种基因型GCRV中均扩增出大小约590 bp的特异性条带;灵敏度试验结果显示,该方法对于I、Ⅱ、Ⅲ型GCRV的检测限分别为380、250和380拷贝/μL。该方法可特异性地检测目前已知的三种基因型GCRV,而在大鲵虹彩病毒(GSIV)、锦鲤疱疹病毒(KHV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(CyHV-2)、鲤春病毒血症病毒(SVCV)和传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)中无扩增产物。利用该方法检测49份草鱼出血病疑似样品,结果显示均为GCRV阳性,其中I型阳性率为8.2%,Ⅱ型阳性率为85.7%,Ⅲ型阳性率为2%,I、Ⅱ型混合感染阳性率为4.1%,其他类型的混合感染未检测到。结果表明,本研究建立的针对I、Ⅱ和Ⅲ型GCRV的RT-PCR检测方法具有通用性好、省时高效的突出特点,同时还兼具较高的灵敏度和特异性。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

学术咨询 免费咨询 杂志订阅