摘要：用ISSR标记对来自中国西南地区（四川、重庆、贵州）的28份扁穗牛鞭草材料的遗传多样性进行了检测.从96个ISSR引物中共筛选出13个多态性明显、反应稳定的引物.28份材料的DNA共扩增出129条谱带,平均每个引物扩增出9.9条带,多态性条带比率达84.2%.材料间遗传相似系数为0.466～0.980,表现出丰富的遗传多样性.通过聚类分析和主成分分析,将28份扁穗牛鞭草分为两大类,同一地区的扁穗牛鞭草品种（系）基本聚在同一类,呈现出一定的地域性分布规律.

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