作者:梁威; 杨铁柱; 沈和定; 许国绿; 顾冰宁; 薛宝宝 期刊:《水产学报》 2019年第11期
钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅳ(CaMKⅣ)是一种广泛存在于真核生物中的调控因子,在生物体内具有多种生理功能。为了探究瘤背石磺中CaMKⅣ的作用和分子机制,为进一步阐述CaMKⅣ的生理功能提供科学的理论依据。本实验以瘤背石磺神经节为实验材料,利用RACE-PCR技术克隆得到CaMKⅣ基因的cDNA序列,并进行生物信息学分析和qRT-PCR实验。结果显示,瘤背石磺CaMKⅣ基因的cDNA全长1603bp,开放阅读框为1032bp,5′非编码区315bp,3′非编码区256bp...
作者:王红莹; 方瑞 期刊:《安徽农学通报》 2016年第08期
为了深入研究鱼类RNA剪接相关基因snrpc的作用机制,实验应用RT-PCR研究了斑马鱼成鱼组织中snrpc mRNA的表达模式,并比较分析了鲫鱼中snrpc的表达。结果显示,斑马鱼snrpc在垂体和卵巢中有表达,而鲫鱼中在肾脏、垂体和卵巢中有表达,表明snrpc在不同鱼类中具有组织表达的差异性。
作者:毕春晓; 刘凤娟; 曲瑞红; 胡鑫; 徐全乐 期刊:《北方园艺》 2018年第18期
以大岩桐(Sinningia specisoa)茎尖组织为试材,采用RT-PCR方法对大岩桐SsKN1(KNOTTED1-like homeobox)基因进行克隆,经BLAST比对、邻接法构建进化树,研究了SsKN1基因与其它KNOXI基因的亲缘关系;并利用半定量RT-PCR,研究了SsKN1基因在大岩桐根、花瓣、花萼、叶、茎和茎尖等不同组织中的表达情况,以期为SsKN1基因的功能研究奠定基础。结果表明:获得了大岩桐SsKN1基因451bp的cDNA序列,该基因与烟草NTH15基因亲缘关系最近,其次为...
作者:赵丹; 闫晓平; 陆秀君; 郭巍 期刊:《中国生物防治学报》 2018年第05期
cdsRDNA文库免疫筛选到编码暗黑鳃金龟幼虫几丁质脱乙酰酶HpdsRCDA5基因,序列分析表明HpdsRCDA5含有1个几丁质脱乙酰酶结构域,属于GroupdsRV类CDA蛋白。构建重组杆状病毒表达载体pdsRFastdsRBac-HpdsRCDA5,转染昆虫细胞sf9,WesterndsRblot分析表明HpdsRCDA5在昆虫细胞sf9中成功表达42dsRkdsRDa的蛋白。利用qdsRRT-PCR方法分析HpdsRCDA5基因组织表达,结果显示HpdsRCDA5基因在中肠中表达最高,为中肠特异表达蛋白。几丁质结合活性表明...
作者:李晓雪; 王勇; 孙继奇; 朱晔荣; 马琳; 向蓓蓓 期刊:《西北植物学报》 2018年第08期
该研究根据川西獐牙菜转录组信息获得7-脱氧马钱子酸羟化酶(SmDL7H)基因的全长cDNA序列,对该基因进行同源克隆、生物信息学分析,并构建原核表达载体、转化大肠杆菌、进行原核表达和组织特异性表达分析,以探讨川西獐牙菜裂环烯醚萜合成途径中关键酶7-脱氧马钱子酸羟化酶(SmDL7H)基因的功能,为研究裂环烯醚萜类化合物合成途径奠定基础。结果表明:(1)成功克隆了川西獐牙菜SmDL 7 H基因(GenBank登录号为MH243070);SmDL 7 H基因开放阅读...
作者:邢潇; 宋如昕 期刊:《山西农业科学》 2018年第06期
中华鳖(Pelodiscus sinensis)的α-(1,2)岩藻糖基转移酶2(fucosyltransferase 2,FUT2)基因可以合成岩藻糖,岩藻糖作为一种糖类,能够为肠道某些细菌提供能量,在维持肠道微生物的内稳态中发挥着调控作用。利用RACE技术首次获得了中华鳖fut2基因的c DNA全长序列,进而预测和分析fut2基因的蛋白质序列及其功能区域,同时对其在10个组织中的表达水平进行检测与分析。结果显示,该序列全长1 918 bp,其中,5'非编码区(5'-UTR)380 bp,...
作者:孙佳斌; 刘乃勇; 李双美; 闫祺; 董双林 期刊:《昆虫学报》 2018年第06期
【目的】鉴定斜纹夜蛾Spodoptera litura新的信息素结合蛋白(pheromone binding protein,PBP)基因,明确其在斜纹夜蛾不同组织中的表达水平并探讨其功能。【方法】基于已报道的烟草天蛾Manduca sexta、家蚕Bombyx mori、君主斑蝶Danaus plexippus和庆网蛱蝶Melitaea cinxia 4种非夜蛾科昆虫PBP4同源基因的序列特点及与其他PBP基因在染色体上的相邻关系,通过分析实验室先前克隆到的斜纹夜蛾PBP/GOBP基因序列,克隆斜纹夜蛾PBP4同源...
作者:李会萍; 黎帮勇; 胡尚连; 曹颖 期刊:《西北植物学报》 2017年第02期
基于慈竹转录组数据库,从慈竹笋克隆得到2个NAC基因,分别命名为BeNAC3(GenBank登录号KU821587)和BeNAC4(GenBank登录号KU821588),在生物信息学分析的基础上,研究了2个基因的组织表达模式和转录活性。TMHMM软件和系统进化分析表明,BeNAC3和BeNAC4都有一个明显的跨膜结构域,可能是膜结合蛋白,且两者分别与NAC2亚家族和ANAC011亚家族有较高相似性。根据BeNAC3在笋、未展开叶、展开叶和茎中的相对表达量,及其在进化树中与NAC2...
作者:胡欣欣; 曹建萌; 卢迈新; 陈琼; 陈昆平 期刊:《淡水渔业》 2017年第01期
为了探究补体C9在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)免疫中发挥的作用,本研究克隆并分析了尼罗罗非鱼补体C9基因(OnC9)。结果显示:OnC9的cDNA序列全长2 502 bp,包含1 761 bp的开放阅读框(ORF),编码586个氨基酸。氨基酸序列同源性分析表明,OnC9与牙鲆(Paralichthys olivaceus)补体C9氨基酸相似性最高,达73.0%,与其他鱼类补体C9的相似性介于49.3%~71.4%之间。实时荧光定量PCR检测结果表明,OnC9基因在所检测的各个组织或器官中表达水...
作者:张向前; 董新龙; 凌姣姣; 韩昆鹏; 张涛; 王金玉; 王永娟 期刊:《中国畜牧兽医》 2016年第07期
同源异型盒基因(homeobox genes,HOX)是在酵母乃至人类等几乎所有的真核细胞中均表达的一类基因。为了探究HOXC10基因表达规律及其生物信息学,采用qRT-PCR方法研究HOXC10基因在8周龄京海黄鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿肌、下丘脑和卵巢组织中的表达规律,检测其在300日龄高、低产组卵巢组织的表达差异,并通过多种在线软件对原鸡HOXC10基因进行生物信息学分析。结果显示,HOXC10基因在京海黄鸡腿肌中表达丰度极显著高...
作者:陈鸿翰; 袁梦求; 李双江; 赵海霞; 陈惠; 李成磊; 吴琦 期刊:《农业生物技术学报》 2013年第02期
肉桂酸羟化酶(C4H)是植物苯丙烷代谢通路中的第二个酶,该酶在植物细胞中的含量可以影响木质素和黄酮类物质的合成等多条代谢支路。为进一步揭示苦荞黄酮合成的分子机制,对苦荞C4H基因的全长序列进行克隆。本研究采用RT—PCR和RACE技术从苦荞(Fagopyrum tararicum)花蕾中克隆得到一个肉桂酸羟化酶基因的全长cDNA(FtC4H)。结果表明,FtC4H基因的ORF全长为1515bp,编码504个氨基酸,具有C4H的所有活性位点。利用半定量RT.PCR...
作者:张营 郁建锋 杨丽 王星果 顾志良 期刊:《动物学研究》 2010年第05期
窖蛋白(Caveolin)是一类构成细胞膜上胞膜窖主要结构的标志蛋白,由Caveolin基因家族编码而成。Caveolin-1基因是Caveolin基因家族的成员之一。该实验采用RT-PCR与RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术成功地克隆了家鸽Caveolin-1基因的全长cDNA。该cDNA全长2605bp,包含537bp的完整编码区,编码178个氨基酸;分析发现家鸽Caveolin-1基因编码区与牛、家犬、鸡、褐家鼠等核苷酸同源性为80.1%~93.4%,氨基酸同源性高达85.4%~...
作者:邵芳 郁建锋 张燕萍 卢祥云 徐建荣 朱斌 顾志良 期刊:《南京农业大学学报》 2013年第01期
以赤眼鳟(Squaliobarbus crriculus)肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR结合RACE方法,获得其myostatin(肌肉生长抑制素)基因全长为2 214 bp的cDNA序列,其包含了1个含有1 128个核苷酸的开放性阅读框(ORF),共编码375个氨基酸。赤眼鳟与其他物种myostatin的特征性一致。其编码区序列与鲤鱼同源性最高,为96.99%,与其他鱼类的同源性为76%~81%,与哺乳类和鸟类的同源性较低,为63%左右。赤眼鳟Myostatin蛋白的氨基酸序列与其他物种同源性较...
作者:汤玲 赵敏 张军 赵玉飞 李名扬 眭顺照 期刊:《西南农业大学学报》 2014年第02期
通过随机挑取克隆测序的方法从蜡梅花cDNA文库中获得了蜡梅谷氧还蛋白基因,命名为CpGRX1(Gen-Bank登录号:JQ990126).该基因cDNA全长为491bp,其中包含的开放阅读框长为321bp,编码蛋白分子量约为11.18kD.生物信息学分析表明:CpGRX1蛋白属于典型的亚类I(即CPYC型)谷氧还蛋白.实时荧光定量PCR分析表明:CpGRX1基因在蜡梅的根、茎、叶、花等组织中均有表达,其在茎中的表达量显著高于其它组织;在开花过程中,CpGRX1基因在蕾期、盛开...
作者:施秋燕 杨志刚 王伟 姚琴琴 王瑶 成永旭 期刊:《生物技术通报》 2015年第09期
旨在探讨三疣梭子蟹高度不饱和脂肪酸自身合成能力,探究三疣梭子蟹HUFA生物合成途径。采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到三疣梭子蟹△6去饱和酶cDNA 全长序列,并利用荧光定量PCR技术进行肝胰腺、肠道、鳃等8种组织的表达分析。通过分析序列表明,基因序列全长2875 bp,其中5'非编码区长465 bp,3'非编码区长1078 bp,开放阅读框(ORF)长1332 bp,编码443个氨基酸;并且编码的蛋白序列具有典型的去饱和酶特性:3个组氨...
作者:李艳艳 邵芳 吴小娟 石亦静 郁建锋 顾志良 期刊:《农业生物技术学报》 2015年第03期
肌球蛋白是组成肌原纤维粗丝的主要成分,在肌肉生长发育和运动收缩过程起重要作用.本研究采用反转录PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification cDNA ends,RACE)方法,从太湖鹅(Anser anser)肌肉中克隆到肌球蛋白重链1基因(myosin heavy chain 1,MyHC1)的全长cDNA,并运用生物信息学的方法对其进行分析,实时荧光定量PCR(Real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)检测MyHC1基因在鹅胚胎期的表达情况.研究结果表明,鹅...
作者:裴爱君 杨艳津 秦艳杰 赵祥吉 闫喜武 李霞 王福景 期刊:《大连海洋大学学报》 2015年第02期
采用反转录PCR(RT-PCR)与c DNA末端快速克隆(RACE)法首次从壳长为28 mm的菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum外套膜中克隆出RP2基因(Gen Bank登录号:KF826881)。结果表明:RP2基因c DNA序列长度为1158 bp,包括62 bp的5'端非编码区,41 bp的3'端非编码区,开放阅读框1053 bp,编码350个氨基酸;推导的氨基酸序列具有TBCC(57aa~175aa)和CARP(65aa~102aa)保守结构域,并为非跨膜糖蛋白;经Blast同源性比较表明,菲律宾蛤仔RP2氨...
作者:吕新芳 孔令明 王学广 张晓雨 王文泉 杜宗军 李玉春 期刊:《山东大学学报·理学版》 2015年第11期
分别用灿烂弧菌(Vibrio splendidus)和鳗弧菌(V.anguillarum)对仿刺参(Apostichopus japonicus)进行注射感染试验,取注射后0、3、6、9、12、24 h的仿刺参体壁、肠道、呼吸树、触手和体腔细胞5种组织或细胞进行了实时荧光定量PCR检测,分析硫氧还蛋白(Thioredoxin,Trx)基因在这5种组织或细胞中的表达特征,探讨了硫氧还蛋白在仿刺参先天免疫中的作用。结果显示,Trx基因在仿刺参体壁、肠道、触手、呼吸树及体腔细胞中均表达;在...