作者:杨宇虹; 李娜 期刊:《辐射研究与辐射工艺学报》 2020年第01期
作者:全东令; 陈凯; 管怡晴; 张静茹; 杨丹妮; 吴焕贤; 张国华; 吕琳 期刊:《中华肿瘤防治》 2020年第01期
作者:马宁宁; 刘占; 史志斌; 赵小月; 邓梦梦; 郭子仪; 陈陆 期刊:《中国病原生物学》 2019年第12期
目的利用生物信息学分析抑制抗原加工相关转运体(TAP)肽转运的伪狂犬病病毒(PRV)蛋白。方法和用在线分析软件分析HSV-1 ICP47,BoHV-1 UL49.5.HCMV US6.EBV BNLF2a.CPXV CPXV012等5种已知TAP抑制剂的理化性质、疏水性跨膜域、磷酸化修饰、亚细胞定位、信号肽、二级结构等,筛选出与几种TAP抑制剂相似的PRV蛋白,并对TAP抑制剂和筛选出的PRV蛋白进行同源比对及三级结构预测和分析比较。结果筛选出与TAP抑制剂BoHV-1 UL49.5同样存在--个...
作者:李然红; 陈鑫; 刘丹; 姜静 期刊:《分子植物育种》 2019年第21期
EIN3/EILs是乙烯信号转导过程中的重要转录因子,在植物抗逆及不同激素协同和拮抗反应中具有重要作用。本研究通过RT-PCR方法扩增得到白桦BpEIL1基因序列,并利用生物信息学方法对获得的序列进行结构及功能预测。结果表明,白桦BpEIL1基因全长为2968 bp,CDS为1776 bp,编码的蛋白由591个氨基酸构成,属于EIN3超家族成员,是一个亲水性的不稳定蛋白。在白桦基因组中共找到2个EIN3超家族基因,与模式植物拟南芥和毛果杨EIN3超家族基因序列进...
作者:陈莹; 潘王韵; 林思祖 期刊:《分子植物育种》 2019年第24期
为了对金线兰查尔酮合成酶CHS和黄酮醇合成酶FLS进行基因的克隆和生物学信息分析,本研究参照测序得到的金线兰CHS与FLS基因的序列,设计特异性引物进行扩增。利用软件,对金线兰CHS和FLS蛋白的生物信息进行预测分析。结果显示,金线兰CHS基因的CDS总长度1 185 bp,编码394个氨基酸,金线兰FLS基因的CDS总长度1 035 bp,编码344个氨基酸。金线兰CHS蛋白与FLS蛋白皆是酸性、亲水性、无信号肽、非分泌、非跨膜蛋白,亚细胞定位在其他细胞器上...
作者:梁振; 董郊; 李凤杰; 杨泽宇; 王延洲; 梁志清 期刊:《第三军医大学学报》 2020年第02期
作者:孙祎璠; 马俐; 龚小慧; 洪文超; 蔡成 期刊:《中国当代儿科》 2020年第01期
作者:田万年; 徐雪雪; 张佳娟 期刊: 2020年第01期
为了解吉林省延边地区流行的羊泰勒虫种类,采用血涂片镜检和PCR方法对羊泰勒虫进行鉴定和遗传学分析。血涂片镜检观察发现,血涂片红细胞中存在圆形虫体。对羊泰勒虫MPSP基因生物信息学分析显示,MPSP编码的蛋白包含3个N-糖基化位点,14个潜在抗原表位,含有信号肽结构。建立系统进化树显示,分离到的3个虫株与Theileria luwenshunli(GQ281044)同源性为100%,亲缘关系较近,分离的羊泰勒虫为吕氏泰勒虫。由该试验结果可以得出,吉林省延边...
作者:王荣; 谢丽秋; 韦家柱; 韦颖; 陆安; 彭业凤; 王俊利 期刊:《右江医学》 2019年第11期
目的筛选非小细胞肺癌(NSCLC)的关键基因,探索其与发病关系。方法从开放基因芯片数据库(GEO)检索有关非小细胞肺癌表达的数据,利用GEO2R方法筛选存在表达差异的基因,分析关键基因和非小细胞肺癌预后的关系。结果共选入3套非小细胞肺癌基因芯片数据,选出有交集且未报道的差异表达基因4个,其中ADCY4基因与非小细胞肺癌预后有关。结论利用生物信息学技术能有效筛选出目标基因,ADCY4基因或许为非小细胞肺癌新的目标研究分子,并可为进一...
作者:刘乔; 姚丽; 张泓辰; 张佳瑞; 巩丽; 朱少君; 韩秀娟; 兰淼; 张富琴; 张伟 期刊:《现代肿瘤医学》 2020年第04期
作者:冯青青; 赵文文; 赵文飞; 于文静; 闫文娴; 魏红梅 期刊:《山东医药》 2020年第01期
作者:邱斌; 刘玮; 刘丽娜; 宗爱珍; 贾敏; 徐同成 期刊:《中国食品学报》 2020年第01期
通过转录组学及其生物信息学分析,研究反亚油酸诱导人脐静脉内皮细胞差异表达基因及相关信号转导通路,结果发现:126条基因发生显著变化,其中28条基因显著上调,98条基因显著下调。生物信息学分析结果表明:与细胞组成相关基因共54条,而涉及分子功能的基因共118条。本研究共富集到相关信号通路99条,其中显著变化的7条,包括萜类骨架生物合成通路、类固醇生物合成通路和肿瘤坏死通路等。根据PPI基因互作通路图,研究同时参与不同信号转导...
作者:陈娟; 刘传丽; 陈艳思; 王振国; 孔祥玲 期刊:《东南国防医药》 2020年第01期
作者:本刊编辑部 期刊:《科研信息化技术与应用》 2009年第03期
<正>美国国立卫生研究院(NIH)资助的部分项目:1)项目名称:蛋白质对接算法开发(Continual Developrnent of Protein Docking Algorithms)项目负责人:Weng,Zhiping(副教授)项目承担单位:马萨诸塞大学医学院起始日期:2009年5月1日完成日期:2013年4月30日在2009财年拨款的项目经费:311,442美元NIH研究所:NIGMS(美国国立综合医学科学研究所)摘要:本项目的目标是发展计算方法、算法和软件用于预测蛋白-蛋白复合物的三维结构。这种...
作者:葛剑徽 期刊:《科研信息化技术与应用》 2009年第03期
生物信息学是在生命科学、计算机科学和数学的基础上逐步发展而形成的一门新兴交叉学科。本文简要介绍了生物信息学的产生背景及其发展,目前生物信息学的主要研究内容以及发展前景。
近日,中山大学教育网格主节点平台选定曙光4000L超级计算机。据曙光公司副总裁聂华介绍,本次中山大学承建的是国内教育行业最为高端的信息化项目“国家教育网格”,通过对国内外各类高性能计算机系统的比较,中山大学最终选择了在“网格”建设方面有深厚积累的国内曙光公司进行合作,采用成熟的曙光4000L超级服务器作为网格平台主节点。中山大学网格计算平台建成后,将为图象处理、生物信息学、
作者:胡艳瑾; 陶阿丽; 卫强; 施伶俐; 白娟 期刊:《信息周刊》 2019年第22期
生物化学是药学专业的必修基础课程,蛋白质结构与功能部分是本课程的教学重点之一,对于理解生命现象的本质和蛋白质类药物的设计都是尤其重要的。但这部分内容难度较大,给学生的学习带来很大困难。生物信息学软件是预测蛋白质结构的有力工具之一,能够直观地看到蛋白质的结构,从而更好地理解结构和功能的关系。本文探索运用生物信息学软件展示学生感兴趣的蛋白质结构,并以hGluRS 2蛋白为例,使用在线软件分析hGluRS 2性质,展示其结构...
作者:黄耀江; 李雪; 董明盛; 刘越 期刊:《生物学通报》 2007年第06期
随着人类基因组测序工作的完成,单核苷酸多态性作为继限制性片段长度多态性和微卫星多态性这2种遗传标记之后的第3代遗传标记,已成为人类后基因组时代的主要研究内容之一。系统地介绍了人类基因组中单核苷酸多态性的传统检测方法、新的方法以及基于生物信息学的方法,并对SNP检测技术的发展进行了展望。
作者:张舒蕾; 肖明 期刊:《生物学通报》 2006年第10期
利用生物信息学的方法,分析黄病毒科成员的进化关系,为研究病毒的重组机制、起源、为研制有效的抗病毒药物提供理论基础。